Защита программного обеспечения

Здравствуйте. Является ли надежной защитой вынос конфигурационного xml файла настроек в ключ, при использовании шифрования RSA при передаче данных? Xml модифицируется при каждом запуске программы.

Не является.
В ключе нужно что-то рассчитывать (что-нибудь ключевое и важное для функционирования программы).
Простое хранение конфига бессмысленно.